元气骑士中部分角色拥有独特的隐藏技能，这些技能不会直接显示在角色面板上，需要玩家通过特定操作触发。其中最典型的是气宗的激光波技能，触发方式为先用普通攻击让气宗停留在剪刀动作，随后按下技能键并连续点6下普攻，再次点击技能键即可释放激光波。该技能蓄力时间越长，释放时间越长且效果越强，但冷却时间也会相应增加。只有手刀或天地通意拳平A才能触发该效果。
恶魔角色作为隐藏角色同样拥有特殊机制，其被动技能恶灵宿主在击杀敌人或对BOSS造成一定伤害时，可召唤火焰小鬼辅助作战。解锁恶魔需要携带史莱姆宠物并使用狼人角色通关高难度关卡，之后需点击四个火坛各15次触发隐藏路径，击败镇守恶魔的BOSS后有概率获得该角色。战斗存在5分钟时间限制，对操作技巧要求较高。
刺客职业的隐藏皮肤往往伴随特殊技能效果，需通过完成特定任务、参与活动或使用兑换码获取。部分皮肤具有独特的攻击特效或增益效果，例如提升暴击率或改变技能形态。获取这类隐藏皮肤需关注游戏动态并参与限时活动，某些皮肤需要通过交易市场与其他玩家交换获得。
法师的寒冰穿刺技能存在隐藏强化机制，搭配霰弹增加、冰盾等天赋可显著提升控制效果。该技能在叠加特定天赋后，冰冻范围和持续时间会得到增强，使其从辅助技能转变为强力控制手段。合理搭配天赋树可使法师在特定场景下发挥超出面板数值的实战效果。
部分隐藏成就的达成条件与技能机制相关，如神秘仪式需要在特定场景使用敬礼表情触发。这类隐藏内容通常需要玩家在非战斗场景进行特殊交互，探索游戏中的细节设计有助于发现更多隐藏要素。部分联机专属武器如香蕉、网球拍等，其特殊效果也属于广义的隐藏技能范畴。
